兗州市博物館位館藏豐富，有自大汶口文化至明清歷代文物3500多件，包括興隆塔塔底出土的珍貴文物。博物館呈軸南北向。北部為興隆塔遊覽區。中部是陳列館，陳列館建築採用仿漢闋、大斜坡房頂的外觀造型，氣勢宏偉，古樸典雅，莊重大方，與興隆塔前後呼應，渾然一體。二層設五個展廳。分別是文明曙光廳、文物精品廳、天下第一劍廳、李蒂根藝廳和名家書畫廳。

文明曙光廳陳列了兗州地區發掘出土的史前文化遺物300餘件，其中有中科院考古研究所發掘的王因遺址、西吳寺遺址、六裏井遺址等，這些遺址系統地反映了山東地區新石器時期的文化發展序列。

文物精品廳陳列了館藏文物精品中的青銅器、瓷器、石刻造像、金玉飾品等幾個專題。

天下第一劍廳的大劍是生鐵模鑄而成，劍柄鑄有銘文"康熙丁酉二月知兗州府事山陰金一鳳置"，劍長7.5米，重1539.8公斤，被譽為“天下第一劍”。

兗州市博物館位於市中心的文化東路上，可同興隆塔一起參觀。

門票免費。

開放時間8:30-11:00，14:00-17:00。