16路 （南京西站→新和源裝飾城站）
南京西站 - 熱河路 - 鹽倉橋廣場西 - 薩家灣 - 三牌樓 - 虹橋 - 西流灣公園 - 大方巷 - 鼓樓 - 鼓樓醫院 - 珠江路南站 - 新街口南站 - 三元巷 - 內橋 - 三山街 - 長樂路 - 中華門內 - 雨花路 - 雨花臺 - 西街(地鐵中華門站) - 潤泰市場 - 賽虹橋 - 鳳台南路 - 新和源裝飾城

18路 （水關橋站→新街口南站）
水關橋 - 水關橋西站 - 機務段 - 南京西站 - 熱河路 - 熱河南路 - 南醫二附院 - 農貿中心 - 三汊河 - 龍園北路 - 中保街 - 閩江路 - 清涼門大街(江東北路) - 東寶路 - 江東門北街(茶西) - 鳳凰西街西 - 鳳凰三村 - 鳳凰西街 - 鳳凰街 - 漢中門(漢中路) - 莫愁路(漢中路) - 新街口西站 - 新街口南站

100路 （安德門站→南醫二附院總站）
安德門 - 能仁裡 - 雨花西路 - 窯灣街 - 釣魚臺 - 新橋 - 升州路 - 張府園 - 三元巷 - 新街口南站 - 新街口北站 - 珠江路北站 - 鼓樓 - 大方巷 - 山西路 - 虹橋 - 三牌樓 - 薩家灣 - 南醫大二附院東院 - 鹽倉橋廣場西 - 挹江門 - 熱河南路 - 南醫二附院 - 姜家圩 - 姜家園南站 - 南醫二附院總站

27路 （農花村站→新街口南站）
農花村 - 宏運國際村 - 岔路口西站 - 江寧裝飾城 - 氣象學院 - 雙龍街 - 夾崗 - 窨子山 - 春天家園 - 紅花鎮 - 後江沿 - 光卡路 - 馬家圩 - 中和橋 - 光華門 - 大光路 - 解放南路 - 公園路 - 常府街 - 揚公井 - 戶部街 - 新街口 - 長江路 - 新街口南站

28路 （長途東站→湖西街站）
長途東站 - 省經幹院 - 花園路 - 板倉村 - 崗子村 - 鎖金村 - 新莊廣場南 - 新莊廣場西 - 火車站廣場東 - 火車站廣場西 - 中央門東站 - 中央門南站 - 許府巷 - 玄武湖隧道 - 公交總公司 - 鼓樓北站 - 鼓樓醫院 - 珠江路北站 - 新街口南站 - 三元巷 - 張府園 - 建鄴路 - 朝天宮 - 水西門 - 長虹路北站 - 長虹路 - 集慶門橋 - 彩虹苑 - 南湖集貿市場 - 南湖路 - 湖西街

33路 （雨花臺南門站→南京火車站）
雨花臺南門 - 望江磯 - 花神廟(雨花臺中學) - 紫荊花路 - 寧南小區 - 紫荊花路東 - 卡子門西站 - 養回紅村 - 雨花臺東門 - 雨花路立交橋 - 雨花路 - 中華門內 - 長樂路 - 三山街 - 內橋 - 三元巷 - 新街口南站 - 珠江路北站 - 鼓樓醫院 - 鼓樓北站 - 玄武湖公園 - 公交總公司 - 玄武湖隧道 - 中央門南站 - 中央門東站 - 南京火車站

34路 （中山碼頭站→石門坎(五洲家居裝飾廣場)站）
中山碼頭 - 中山橋 - 鹽倉橋廣場西 - 薩家灣 - 三牌樓 - 虹橋 - 西流灣公園 - 山西路 - 大方巷 - 鼓樓 - 珠江路北站 - 新街口南站 - 程閣老巷 - 戶部街 - 楊公井 - 常府街 - 公園路 - 瑞金路 - 標營 - 光華門 - 裝飾大世界 - 石門坎(五洲家居裝飾廣場)

35路 （集慶門站→窯上村站）
集慶門 - 仙鶴街 - 仙鶴橋 - 評事街 - 升州路 - 三元巷 - 新街口南站 - 新街口北站 - 珠江路北站 - 鼓樓北站 - 玄武湖公園 - 公交總公司 - 玄武湖隧道 - 中央門南站 - 中央門北站 - 河路道 - 幹休所 - 五百村路 - 五塘村 - 五塘村東 - 旭日景城 - 黃方村 - 窯上村

38路 （西街站→南堡公園站）
西街 - 窯灣街 - 釣魚臺 - 新橋 - 升州路 - 張府園 - 三元巷 - 新街口南站 - 新街口北站 - 珠江路 - 鼓樓醫院 - 鼓樓 - 玄武湖公園 - 公交總公司 - 許府巷 - 中央門南站 - 中央門北站 - 河路道 - 幹休所 - 五佰村路 - 五塘村 - 白雲新寓 - 上元門 - 燕江路 - 金陵六村 - 南堡公園

306路 （楠溪江東街站→銀城東苑站）
楠溪江東街 - 富春江東街 - 奧體大街(黃山路) - 新安江西街 - 牡丹江西街 - 南湖路南站 - 相子橋 - 虹苑新寓 - 應天西路 - 安泰村 - 沿河村 - 南湖 - 大士茶亭 - 莫愁湖公園 - 水西門 - 朝天宮 - 王府大街 - 秣陵路 - 新街口南站 - 戶部街 - 小火瓦巷 - 太平巷 - 常府街 - 公園路 - 瑞金路 - 月牙湖 - 富麗山莊 - 鐘山花園城 - 東苑北站 - 銀城東苑

41路 （河西金陵中學站→新街口南站）
河西金陵中學 - 白鷺東街 - 怡康街西 - 應天大街 - 安如村 - 沿河村 - 玉塘村 - 大士茶亭 - 莫愁湖公園 - 水西門 - 建鄴路 - 張府園 - 三元巷 - 秣陵路 - 王府大街 - 新街口南站

46路 （景明佳園(景家村)站→鼓樓站）
景明佳園(景家村) - 萬博花卉 - 尹家巷 - 寧南大道西 - 寧南大道 - 翠島花城 - 花神美境 - 寧南大道東站 - 窨子山 - 春天家園 - 紅花鎮 - 洪家園 - 洪家園西 - 土城頭南站 - 土城頭 - 養虎巷 - 大樹城 - 江寧路 - 馬道街 - 箍桶巷 - 長樂路 - 三山街 - 內橋 - 戶部街 - 新街口 - 洪武北路 - 蓮花橋 - 進香河 - 鼓樓